芍藥病害較多，重要有以下幾種：

①葉霉病。該病是一種重要病害，發病初期出現紫褐色黑點，以后逐漸擴大，中心呈淡褐色，邊緣為暗紫褐色，具同心輪紋，秋天成暗褐色。該病由真菌引起，以4~5月份濕潤天氣條件下較易發病。

②輪紋病。發生在葉片上，初為褐色圓斑，呈同心輪紋擴展，釀成黃褐色或暗褐色，病斑常聯絡成不規則狀，后期干枯。該病從傷口處侵入，透風不良，高溫高濕易發生。

③疫病。該病可損害葉、葉柄和莖。葉子發病多從下部葉面開始，出現水漬狀病斑，中心灰綠色，邊緣暗綠色，然后葉凋萎，枯死。

④菌核病。該病是一種真菌病害，溫度20℃左右，濕度80%以上易發生，靠近地面的莖部受害較重，受害后出現水漬狀褐斑，后逐漸擴大腐爛，濕潤條件下外面有白色菌絲層，后集結成玄色菌核。防治方式：上述前3種病害應加強透風，再噴以百菌清或多菌靈800~1000倍液；疫病還可以噴灑400倍液銅汞劑防治。菌核病應實時拔除病株并銷毀，舉行土壤消毒，噴灑托布津50%的500倍液殺菌。