月季較常見的病害有白粉病、黑斑病、枝枯病、銹病等；可能發生的蟲害有數十種，較常見的有介殼蟲、蚜蟲、紅蜘蛛、薊馬、刺蛾蟲、鋸葉蜂等。針對以上病蟲害，要加大力度舉行防治。
在休眠期，也要舉行修剪工作。修剪時間是在春節前后，重要是對2年以上的大棵月季從基部剪除病蟲枝、枯枝、弱枝和重疊枝、交織枝。另外就是劃分根據月季的品種和特征及生長情況舉行不同程度剪枝：對長勢差的植株只保留2-3個主枝，可剪去2/3;對長勢正常，株型正直、勤開花的品種，可剪去1/2左右；對長勢結實、開花頻仍的植株，則只段剪去1/3.對修剪時造成的打的傷口涂抹愈傷防腐膜，促進傷口盡快愈合，防止病蟲侵入。
土壤滅菌：土壤是病蟲害傳播的重要前言，也是病蟲繁殖的重要場所，定植前舉行滅菌處理是防治此類病害的重要方式。土壤滅菌處理的常用方式有蒸汽消毒、藥劑熏蒸如溴甲烷、威百畝等。
注重田間衛生：盆栽月季要注重保持室內透風良好和葉片干燥，在澆水和施肥時不要將水、肥濺灑在葉片上，阻止采取淋澆的方式給水。田間適時適量灌水，阻止田間過濕或積水而誘發各種根莖部病害。實時清除棚內棚外的雜草，不為害蟲提供越冬場所。同時配以藥劑處理，用新高脂膜兌水噴霧，以控制病害的進一步伸張。發現某棵月季得了黑斑病、白粉病請隔離，病葉掐掉，消毀，以防感染給其它植株。
加強設施管理：定期檢查溫室大棚的隔離措施，控制害蟲的侵入；溫室大棚要有足夠的透風除濕能力；合理的澆灌系統，阻止弄濕植株；實時清潔棚膜，隨溫度變化實時透風換氣和排濕。
藥劑防治：使用化學農藥防治時盡可能采取熏蒸(硫磺熏蒸、煙霧熏蒸)，采取噴霧方式時也要盡管選用不易留下污漬的農藥。農藥應噴灑在植株20厘米以下的部位，阻止農藥對切花月季的直接污染。切花月季對克螨特、菊酯類農藥較敏感，容易出現藥害，在防治時要穩重使用。