樹樁盆景的施肥極為考究，施肥過多，枝葉徒長;缺肥，枝條細弱，葉色變黃，易蒙受病蟲害。所以，應做到因時、因量、因肥、因樹種科學施肥。

(1)因時新栽種，初上盆或新換土壤的盆樹，由于根系到損傷，臨時不施肥，待到來年開春或初夏時，盆樹生長旺季的時候多施肥。入秋后盆樹生長遲鈍應少施肥，冬季盆樹已進入休眠期應遏制施肥。在雨天或盛夏高溫的中午前后不宜施肥，因為雨天施肥易流失，并易傷根系。陰天或傍晚時施肥最好，盆土稍干時，先排除盆內雜草松土，有利于肥水滲入土中，使肥料加快解析接收，同時又制止肥害。

⑵因量 樹樁盆景施肥量應把握少量多次的原則，每次施肥量要少，要稀。一般立春到立秋每隔10天追施1次稀薄肥水(7分水3分肥)，立冬后則不施肥。

⑶因肥氮肥促使植株生長繁茂，孕蕾多，常用的氮肥有豆餅、硫銨和肥水。磷肥促進花色艷麗，果實肥大，如施過磷酸鈣碎骨粉等。鉀肥促進根系發家、植株堅挺、常施用的如流酸鉀、草木灰等。要按照植株生長環境別離施肥，同時還要按樹種特性和生長環境而定，機動把握。