1.花葉病。發病初期，莖、葉脈及嫩葉的支脈間呈現水漬斑，隨后在嫩葉上呈現黃綠相間或深綠與淺綠相間的花葉病癥狀，在感病果實表皮上也呈現水漬狀圓斑。低溫期，病株葉片大部門脫落，幼葉呈現畸形。暖和干燥年份，發病嚴重。

防備要領：①選用耐病品種，加強栽培打點，加強植株抗病、耐病本領。②實時挖除病株，沒落病源。③沒落田間蚜蟲，節制病毒的傳播。

2.疫病。重要為害木瓜果實，先在果實蒂部發病。病部水漬狀，淡褐色。天氣濕潤時，果實很快腐朽，病部上面著生有稀疏的白色霉層。此病在適溫高濕的條件下發病較重。

防治要領：①一旦發明此病，可用如下藥劑舉辦防治：58％瑞毒霉錳鋅可濕性粉劑600倍液;64％殺毒礬可濕性粉劑500倍液;72.2％普力克水劑400～600倍液;90％乙磷鋁可濕性粉劑500倍液：1％波爾多液。每隔10～15天噴1次，噴藥次數視病情及天氣而定。②留意清園，實時排除田間的病果及病苗。

3.炭疽病。是一種產生普遍、為害嚴重的病害。此病終年皆可產生，以秋季發病較嚴重。番木瓜炭疽病重要為害果實，其次為害葉片和葉柄。被害果的果面開始呈現數個污黃白色或暗褐色的小黑點，呈水漬狀，病斑逐漸擴大，到直徑約5～6mm時，病斑下陷，斑面呈現同心輪紋，輪紋上發生無數突起。葉片上，病斑多產生于葉尖及葉緣，病斑褐色，形狀犯科則。病斑長出小斑點。在葉柄上，病斑多產生于將脫落或已脫落的葉柄上，病部沒有明明邊界，其上面呈現一堆堆玄色小點，病部不下陷。

防治要領：①加強栽培打點，種植時要施足基肥，使植株生長結實，淘汰病害產生。②留意清園，隨時摘除病果、病葉，收集病株殘體會合燒毀。③幼果期用0.5％波爾多液，40％滅病威懸浮劑500倍液，70％甲基托布津可濕性粉劑800～1000倍液，50％多菌靈可濕性粉劑或75％百菌清可濕性粉劑600～800倍液舉辦防治。