該所系統與進化植物學國度重點嘗試室洪德元院士領銜的研究團隊通過較量闡明葉綠體基因組，揭開了花王牡丹的出身之謎—本來牡丹的傳統品種共搜集了我國華夏地域5個野生品種的遺傳資本。

自20世紀90年月起，植物所重點嘗試室的牡丹、芍藥研究團隊就開始觀測牡丹植物資本。科研人員通過遍及的野外考查、居群取樣和統計闡明，確認牡丹有9個野生品種，分布于從西藏東南至華夏的地域，為中國所特有。研究人員操作基因標志，重建了9個野生種牡丹的系統發育干系，同時還通過較量闡明葉綠體基因組，找出了14個高判別率的葉綠體基因。

科研人員又隨機選取47個牡丹傳統品種舉辦闡明，成果發明，這些傳統品種源自我國華夏地域的5個野生種之間的雜交。據宋代“洛陽牡丹譜”記實的花王牡丹形成的人文線索，居住在華夏地域的先人喜愛牡丹，把四周不同的牡丹野生種引入庭院栽培，為這些品種締造了天然雜交的時機，導致種間遺傳整合，使兒女牡丹的花色、花形千變萬化。

這一研究不只揭開傳統牡丹品種來歷之謎，同時也進一步表分明花王牡丹如此姹紫嫣紅的原因。