花港觀魚公園內的牡丹園在首屆“中國公園年度較佳植物專類園區”評選活動中脫穎而出，與北京市植物園海棠園、上海市植物園盆景園等16家植物專類園區配合被評選為“中國公園2012―2021年度較佳植物專類園區”。

牡丹園是花港觀魚公園的主景區之一，也是整個公園立面構圖的中心。牡丹園的構圖，借鑒中國畫的立意和意境，以牡丹為主題，再配以崎嶇錯落、疏密得體的山石和花木，雖由人做，宛如天開。牡丹園總面積約為1.28公頃，其中栽植牡丹的假山區面積約為0.7公頃。園內種植了數百株色澤鮮艷，奇香非常的寶貴牡丹，如魏紫、姚黃、綠玉、胭脂點玉和嬌容三色等。