微型盆景應用墊盆法澆水，就是將盆放進有水的盆中，水以不漫過小盆為好，這樣水可從盆底的孔進入盆中，逐步潤濕整盆土壤。
微型盆景澆水，在春秋季要每天早晚各1次，盛夏炎熱時節，要一日數次，并要經常用水噴灑植株，增添盆景周圍的空氣濕度，防止葉片被灼傷和落葉。
澆灌微型盆景的水，如用自來水，較好放置幾天后使用，這樣可以防止盆土堿性化。
為了利便管理，削減水分的蒸發，微型盆景應適當遮陽，還可以在放置盆的地方，鋪些濕沙，厚3.3厘米左右，這樣就可以削減澆水和噴水次數，減輕勞動強度。