【病原】病原菌為祁連金銹菌(Chrysomyxa qilianensis Wang，Wu et Li)，其發育階段[0]、[Ⅰ]在云杉針葉上，[Ⅱ]發生在青海杜鵑葉后頭，其生活史為中缺夏孢子型。性孢子器瓶狀，淡黃色，150～216μm×115～150μm，埋生于針葉表皮下，其孔口突出表皮。
銹孢子器口徑0．2～0．3mm，包被膜質，淡黃色，破碎后呈白色，包被細胞長橢圓形，矩形，49～54μm×27～34μm，內壁厚5μm，外壁1．7μm，內外壁均平滑。銹孢子器半埋于針葉組織內，器內串生多數銹孢子，銹孢子淡黃色，近圓形或近橢圓形，26～34μm×17～24μm，孢膜厚3．5μm左右，無色，外面有密而短的疣點。
冬孢子堆頭狀，外圍有一層擬蠟質保護物，桔紅色。基部束梗淡黃色，長0．2～0．5mm。
冬孢子單胞，無色，長橢圓形，17—26μm×10一14μm，多數為4～5個一串，串長100～135μm。

【發生紀律】病菌冬孢子6月中旬萌發，發生擔子和擔孢子，擔孢子重要通過氣撒播播到云杉幼嫩針葉上侵染。在均勻氣溫14～16℃條件下，潛育期8～11天，6月尾至7月初發病，發生性孢子器。3～5天后發生銹孢子器，7月中、下旬銹孢子陸續成熟，由氣撒播到轉主寄主青海杜鵑上侵染，受侵植株的昔時生葉不顯示癥狀，次年5月尾出現病斑。只有少數病斑在6月初發生冬孢子堆，大多數在第三年6月初才發生大量冬孢子堆。此病害循環中缺少夏孢子階段。病菌以菌絲體在青海杜鵑葉片里越(夏)冬，每年對云杉針葉的有用侵染時期約20天左右。病害與降雨情況有顯著關系，通常6月中旬延續數日有小陣雨，晴、陰交替，這樣的天氣既有利于冬孢子萌發，又有利于擔孢子傳播和侵染。同時由于陰雨降溫，云杉新葉生長緩慢，延伸感病期，病害較重。若遇延續數天大雨，晦氣于病菌孢子傳播和侵染，病害則減輕。
病害隨海拔高度增添而逐漸加重。伶仃木、疏林、林緣以及林冠上部病情較重，郁閉度大于0．7的林內，病情較輕。統一苗床，苗床兩側苗木病情比中心的重，苗木上層病情重于下層。一年生云杉苗無葉銹病，重要緣故原因是幼苗出土后基本上已錯過擔孢子侵染盛期，同時在苗床上尚有覆蓋物或搭起陰棚，起到阻擋擔孢子侵染的保護作用。在統一立地條件下，三四年生苗，病情重于二年生苗，幼林病情一般重于成年林，純林病情重于云杉與樺木、山柏等混交林。陣勢平緩，土層較厚，職位級較高的林分，病害較輕，反之，病情較重。綜上所述，不同林分因子，不同發育階段，不同樹勢，寄主抗病性有著顯著不同。