海棠莖腐病病菌不發生孢子，以菌絲侵人傳播。菌絲初期無色，后期淡褐色。腐生性較強。習居泥土或病殘組織內越冬。氣溫適宜(20-24度)濕度較大，有利于病菌生長養殖。

海棠分株或扦插養殖時造成傷口，或在陰雨天氣，澆水過多，土壤積水時易被病菌侵害，引起病害嚴重產生，植株腐朽滅亡。受害植株在接近土面的莖基部初生暗色黑點，擴大后呈棕褐色，收縮腐朽。病菌侵染葉片引起暗綠色水漬狀圓斑;侵染葉柄則呈褐色腐朽。濕潤時在病斑處可見白色絲狀物，嚴重病株倒狀。

防治要領如下：選用有機質富厚的新土或經曬干后顏色較深、質地堅硬、碎泥時泥粉較少的塘泥及河泥作栽培土。最好不消舊盆土。施用的基肥要充分腐熟;加強田間打點。氛圍濕度大時少澆或不澆水，以保持盆中土壤潮濕為度。少施氮肥，多施磷、鉀肥，實時摘除下部打仗泥土的病葉、老葉并銷毀。