在北京 植物園的建設中，水一直是生長的瓶徑，例如，植物園的澆灌水源不足、缺少水景、水生植被類型較少、 櫻桃溝水源枯竭等等，一直是植物園 景觀建設的缺憾。

植物園水系修復工程的設計目的是，要充分利用水資本，盡管大的可能蓄積雨水并加以利用；因地置宜，形成質樸自然的山水景觀；保護歷史事跡，恢復人文景觀；為水生植物提供栽植條件。

首先對山形水系舉行清算。其次是對駁岸舉行設計和處理。在植物質料上，根據植物園的計劃舉行了植物栽植設計，使各個地區的植物景觀豐富而有特色：西部結合櫻桃溝形成溪流潺潺、地被豐富的山景，而南部湖區彌補展示水生植物景觀，沿海邊水域栽植了20多種水生植物。重要有：梭魚草、千屈菜、水蔥、馬藺等等，豐富了植物園的引種成果，并作為樣板向社會展示水邊的植物景觀。

對櫻桃溝自然保護區及事跡舉行了修繕。由于地下水的匱乏，櫻桃溝水源日漸枯竭，自然溪流景觀面臨消逝，聞名的“水源頭”處已多年沒有了泉涌的情景，溪流沿線的豐富植被由于缺少水源面臨嚴重的威脅。設計中做引水工程，將水上揚至水源頭，恢復了櫻桃溝中“水源頭兩山夾徑，小徑如線，亂水淙淙，深入數里”的景觀效果。水順自然溝谷而下，滋潤著溝底的自然植被，為植被的恢復與保護提供了保障。《天府廣記》中紀錄的自西山通往玉泉山的引水槽，在櫻桃溝中有一段保留完整。設計中將其修繕通水，釀成活的景觀，以潺潺流水指導人們進入櫻桃溝中游覽。

植物園中的水景觀建設的意義在于：湖區極大地改善了植物園原有的生態環境，增添了水生動物和植物的生活空間，使西山四周的水生生物有了生息和繁衍的場所，空氣濕度增添，為植物生長提供加倍良好的環境；為植物澆灌彌補了水源調治池，解決了植物園在澆灌需要時水源不足的問題。

運行兩年來，旱季和雨季水位落差臨近1米，能夠充分利用雨水彌補植物園的需要；豐富了植物園的水景觀：與原有的噴泉結合，彌補了瀑布、自然溪流段落和靜態湖面的風景，使植物園有加倍豐富的環境空間，吸引了更多的游客入園游覽。